Línea de Investigación Priorizada: SARS-CoV-2
- Presencia del SARS-Cov-2 en animales de compañía y la circulación de coronavirus en roedores sinantrópicos y murciélagos colectados en la provincia del Guayas durante el 2020-2021
Dr. Alberto Orlando – Director del Proyecto
- Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública – INSPI
- Universidad Agraria de Ecuador
- Universidad de Guayaquil
- Universidad de Cuenca
- DR. PET
- Ministerio de Salud Pública
- Universidad Técnica de Manabí
- Gobernación del Guayas.
La familia de virus Coronaviridae abarca un grupo de patógenos con un potencial zoonótico observándose en brotes previos al SARS-Cov 2, como los coronavirus del síndrome respiratorio agudo severo (SARS) y el coronavirus del síndrome respiratorio del Medio Oriente (MERS). El SARS-CoV- 2, es un virus emergente que afecta principalmente a los humanos y es causante actualmente de la pandemia de COVID-19, se conoce muy poco acerca de esta enfermedad, no hay un tratamiento específico, en la actualidad este virus ha provocado una gran cantidad de mortandad a nivel mundial y Ecuador ha sido uno de los más afectado a nivel de América Latina En Ecuador, se desconoce acerca de la circulación de los coronavirus en animales y la relación del SARS-Cov-2 en animales domésticos, por lo cual, es importante considerar el papel que juegan los animales en la posible transmisión de estos virus. El objetivo general es determinar Presencia del SARS-Cov-2 en animales de compañía de la ciudad de Guayaquil y circulación de coronavirus en roedores sinantrópicos y murciélagos en la provincia del Guayas durante el 2020-2021. Los objetivos específicos: 1. Identificar la presencia del SARS-Cov-2 en perros y gatos domésticos en la ciudad de Guayaquil mediante pruebas de Elisa y PCR-RT. 2. Comprobar la dinámica de transmisión humano- animal del SARS-Cov-2 en la ciudad de Guayaquil. 3. Investigar mediante pruebas moleculares la presencia de Coronavirus en murciélagos y roedores sinantrópicos en la provincia del Guayas.
En ejecución
- Vigilancia de SARS-CoV-2 en plantas de tratamiento de aguas residuales y principales cuerpos hídricos de Guayaquil.
Ph.D Leandro Patiño Patiño – Participante
- Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública – INSPI
- Universidad de Guayaquil
- Universidad de Manitoba
- Centro Nacional Patagónico (CENPAT) – CONITEC
Tiene como finalidad determinar la concentración de ARN viral en aguas residuales y explorar su uso para la predicción temprana de brotes, investiga también la presencia de ARN viral en aguas recreacionales y su asociación con contaminación fecal.
En ejecución
- Desarrollo de vacuna de emergencia para COVID-19, causada por el SARS-CoV-2
Ph.D Leandro Patiño Patiño – Participante
- Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública – INSPI
- Escuela Superior Politécnica del Litoral
- Instituto de Ciencia y Tecnología César Milstein (Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas -Fundación Pablo Cassará)
La fase uno es una prueba de concepto para evaluar la tecnología del ADN recombinante en la producción de proteínas virales y evaluar su estabilidad e inmunogenicidad en biomodelos.
En Ejecución
- Desarrollo e implementación de un equipo portátil de bajo costo para diagnóstico descentralizado de COVID-19 en Quito, Tena y Borbón (Ecuador) en el período 2020-2022.
PhD. Varsovia Cevallos – Directora de Proyecto
- Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública – INSPI
- Universidad de Toronto
- Universidad Tecnológica Equinoccial
La implementación potencial de esta plataforma de diagnóstico descentralizada y de bajo costo es una gran promesa para las pruebas basadas en la comunidad que se necesitan para la recuperación de la pandemia de COVID-19. Esta necesidad de pruebas accesibles y de bajo costo es aún más crítica en los países de ingresos bajos y medianos.
El proyecto propone adaptar el lector PLUM portátil para que pueda usarse para realizar ensayos serológicos y de SARS-CoV-2 establecidos en laboratorio y en el punto de necesidad. Esto incluirá la adaptación del hardware PLUM con la incubación a alta temperatura (65 ° C) necesaria para RT-LAMP y con el software especialmente diseñado necesario para permitir el uso de diagnósticos por parte de los usuarios en el campo (por ejemplo, trabajadores de la salud). Esto incluirá un software automatizado que guía a los usuarios en la recolección de muestras, la ejecución de los ensayos, el análisis de datos y el intercambio seguro de datos con las redes de salud pública. El ensayo RT-LAMP se ampliará con nuevas características de protección para evitar resultados negativos falsos y se adaptará para permitir el uso sin extracción de ARN. El ensayo serológico COVID-19 se optimizará para su uso en sitios con facilidades limitadas de laboratorio. Luego de una validación en laboratorio con PLUM, ambos ensayos se implementarán con PLUM en sitios con facilidades limitadas de laboratorio en Canadá, Colombia y Ecuador.
En Ejecución
- Encuesta serológica en poblaciones humanas de la ciudades de: Guayaquil,
provincia del Guayas; Quito, provincia del Pichincha; Loja provincia de Loja y Tena Provincia del Napo en el Ecuador, para detectar IgG anti-SARS-Cov-2, causante de COVID-19 durante julio 2020 a diciembre 2021
Mgs. Doménica De Mora – co directora.
- Universidad Central del Ecuador
- Universidad Reginal IKIAM
- Universidad de las Américas
- Universidad Tecnológica Equinoccial
- Universidad Católica de Santiago de Guayaquil
- Pontificia Universidad Católica del Ecuador
- Universidad Técnica Particular de Loja
- Universidad Católica de Cuenca.
En el presente estudio busca establecer la prevalencia de la infección por SARS-CoV-2 mediante pruebas inmunológicas en poblaciones de las ciudades de Guayaquil (en Guayas), Quito, Loja y Tena, todas afectadas en mayor o menor escala por COVID-19 en el Ecuador. Estos análisis de laboratorio sirven para evaluar la respuesta inmunológica de los infectados están en desarrollo, el estudio de la respuesta inmune en pacientes con COVID-19 es importante por diversos factores como 1) dado que algunos pacientes con COVID-19 son asintomáticos la aplicación de pruebas serológicas ayudará a determinar la tasa real de prevalencia de la enfermedad en una población afectada 2) determinar el nivel de anticuerpos desarrollado puede ayudar a identificar si las personas expuestas al virus desarrollan una inmunidad y en qué medida 3) estudios serológicos pueden ayudar a establecer la dinámica de la respuesta inmune frente a la infección. Objetivo general. Determinar la prevalencia de anticuerpos IgG anti-SARS-CoV-2 en poblaciones humanas de las ciudades de Guayaquil, Quito, Loja y Tena en el Ecuador. Métodos. Recolección de muestras. La técnica a utilizar es Inmuno Ensayos Enzimáticos realizadas en laboratorios y para su validación se utilizaron muestras de personas con COVID-19 que presenten prueba RT-PCR positiva ya que esta es la prueba de laboratorio gold standard para diagnóstico por el laboratorio de COVID-19, y que aceptaron participar voluntariamente en el estudio. En Ecuador, los datos de la infección están en progreso, existen predicciones en base a modelos matemáticos que indican cifras elevadas de posible infección, en el presente estudio Se espera una elevada prevalencia de personas con niveles de anticuerpos IgG anti-SARS-CoV-2 S1 detectables en suero sanguíneo en las ciudades en las que se realizaría el estudio.
En Ejecución
- Genotipificación del virus SARS-COV-2 y seguimientoclínico de pacientes positivos para COVID-19 en dos hospitales de la ciudad de Guayaquil.
Ph.D Leandro Patiño Patiño – Director de Proyecto
- Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública – INSPI
- Universidad Católica de Santiago de
Guayaquil - Hospital Luis Vernaza
- Sociedad Ecuatoriana de Estadística
- Escuela Superior Politécnica del Litoral.
Tiene como finalidad monitorear las variantes de preocupación del virus en pacientes hospitalizados en la ciudad. En el 2020, la DTIDI logró implementar la secuenciación de genomas de SARS-CoV-2 en el INSPI por la tecnología de nanoporos MinION y reportar el caso index de la variante Alfa en el país.
APROBADO PRÒXIMO A INICIAR EJECUCIÓN.
- Co-infección Dengue – SARS COVID 19 en la Provincia de Guayas
Ph.D Leandro Patiño Patiño – Participante
- Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública – INSPI
- Universidad de Guayaquil
- Hospital Abel Gilbert Pontón
Tiene como finalidad evaluar la co-infección entre estos dos agentes infecciosos.
APROBADO PRÒXIMO A INICIAR EJECUCIÓN.
- Red para el desarrollo de herramientas innovadoras aplicadas a la vigilancia epidemiológica en América del Sur.
Ph.D Leandro Patiño Patiño – Participante
- Instituto Pasteur de Montevideo (Uruguay)
- Universidad San Francisco de Quito
- Universidad Mayor de San Andrés (Bolivia) Universidad Nacional de Asunción (Paraguay)
Tiene como finalidad estandarizar a nivel regional la secuenciación y análisis de genomas virales y bacterianos con la tecnología MinION, la primera fase se enfocará en los protocolos de secuenciación de SARS-CoV-2.
APROBADO PRÒXIMO A INICIAR EJECUCIÓN.